金针菇本身是没有毒性的，如果吃没有熟透的金针菇或是有农药污染的金针菇，是有可能导致中毒的。
金针菇中含有秋水仙碱，秋水仙碱经过胃肠吸收以后可以变成二秋水仙碱，二秋水仙碱可以导致身体中毒。金针菇很难清洗，可以把金针菇撕开放在水里面浸泡2小时左右，尽量把残余农药清洗干净，吃金针菇的时候一定要熟透再吃，是可以有效预防金针菇中毒的。
每次吃金针菇不要吃的太多，避免秋水仙碱在体内储存过多而导致中毒，平时需要平衡膳食，对身体健康是有好处的。