头皮下的囊肿目前最有效的治疗办法是选择手术，患者可以在局部麻醉或者静脉麻醉下进行手术操作。巨大的头皮囊肿，当然需要做好植皮的准备。
其属于常见的一种良性疾病，手术切除以后复发几率很小，在术中注意止血，将囊肿病变完整地剥离和切除。
术后也要留置引流，避免出现血肿或者是积液的形成。局部进行加压缝合手术之后根据具体的病情给予相应的抗感染药物，一定要注意定期换药，在术后也要注意定期的进行复查。虽然手术之后头皮囊肿很少复发，但也是需要注意的。