类风湿性关节炎在临床中的主要并发症，包括胸膜炎、间质性肺炎以及心瓣膜炎、胃肠道损伤，甚至还可能会累及神经系统。
在类风湿性关节炎急性发病期，可能容易出现胸膜炎的并发症，典型的表现是胸腔内出现少量的胸腔积液。并发间质性肺炎的患者在临床中可表现为干咳、呼吸困难，甚至还可能会出现乏力以及呼吸衰竭的现象。
类风湿性关节炎累及神经系统时，可能会导致神经肌肉感觉异常。由于类风湿性关节炎需要服用一些抗炎、止痛的药物治疗，所以长时间服用容易引起胃肠道黏膜的损伤。