普通疟疾的治疗以抗疟疾药物应用以及一般对症治疗为主，其治疗风险相对较小，可根据患者自身条件选择是否住院治疗。
但如果患者存在严重并发症或者一般状态较差，则需要住院进行治疗。其常见于不能正常进食、饮水意识淡漠，血压下降、抽搐等表现以及脑型疟疾，孕妇等特殊人群感染等情况，需要接受住院治疗。
需要注意，不管是否进行住院治疗，疟疾患者需要注意自我隔离工作，以避免蚊虫叮咬导致周围人群传播的可能。