牙根长了囊肿，需要进行根管治疗或者手术治疗。
牙根长了囊肿首先要去医院通过X线检查囊肿的大小，囊肿小的进行根管治疗解除感染，囊肿可能会消退。囊肿大的可以采用手术的方式进行治疗，在局麻下对囊肿进行刮治，彻底摘除囊壁避免囊肿复发，术后还需要用抗菌药物预防囊肿继发感染。
如果牙齿有明显松动或者感染，应该先进行拔牙手术再治疗囊肿。注意好口腔清洁卫生，定期进行口腔检查，对于牙齿发黑或者龋洞及时进行治疗，可以预防牙根长囊肿的情况。