硬化性骨髓炎和化脓性骨髓炎，虽然都属于骨组织的细菌感染性疾病，但是还是存在着一定差异。化脓性骨髓炎是属于急性骨髓炎，是化脓性细菌感染到骨组织，产生骨组织的急性化脓性炎症，造成骨组织的破坏、脓肿形成、死骨形成等一系列的病理改变。
硬化性骨髓炎是属于慢性骨髓炎，比如感染的细菌的毒力比较低，患者的免疫力相对强一些，会产生慢性进展的局限性的感染性炎症。骨质在这慢性炎症的刺激下，会出现相应的硬化增殖，从而产生硬化性的骨髓炎的病理改变。
二者在症状上也是有所不同的。化脓性骨髓炎起病急骤，常常会出现高热，同时伴有全身的乏力、恶心、呕吐以及贫血等症状。局部症状也比较明显，表现比较严重的红、肿、热、痛的症状。硬化性骨髓炎的局部症状和全身症状相对来说都比较轻。