可以通过流行病学的接触史、临床症状、辅助检查和预后等多方面来鉴别病毒性上呼吸道感染和新型冠状病毒的感染。
病毒性上呼吸道感染一般没有流行病学的接触史，临床症状一般较轻，一般不会出现胸闷、气短和呼吸困难。病毒性上呼吸道感染的患者，肺CT正常或轻度的间质性改变，新冠病毒核酸检测是阴性的，预后良好。
而新冠病毒感染的患者一般有流行病学的接触史，重症的患者可出现胸闷、气短和呼吸困难。肺CT会出现明显的肺间质改变，新冠病毒核酸检测是阳性的，有小部分的患者预后不良，甚至可危及生命。