如果是低危HPV初期感染的情况下，有可能会出现阴道分泌物增多，外阴偶尔会出现瘙痒。随着HPV病毒在体内存留的时间相对比较长，有可能在生殖道长出灰白色、菜花一样的赘生物。常常是HPV6型、HPV11型感染所导致的，这种病人往往会有高危性生活史或者有多个性伴侣。
如果是高危HPV感染初期，在临床上不会有任何症状，即使是感染了1年、2年或者更长的时间，也有可能不会出现症状。所以对于女性定期地做宫颈癌筛查就非常重要。
如果检查出有高危HPV感染，积极做阴道镜检查。如果没有发现异常，定期地做复查，因为高危HPV有可能自行转为阴性。对于持续感染的病人，一定追踪随访。