小手指疼痛的原因如下：
首先，见于是急慢性的损伤造成。手指发生急性损伤后造成组织水肿、充血，引起疼痛，甚至导致手指关节错位或骨折伤害，引起剧烈的疼痛。慢性损伤会见于过度劳损或长期进行手指工作，引起积累性的损伤，进而诱发炎性反应造成疼痛。
其次，患有风湿性及痛风性的关节炎，也会造成手指关节疼痛。如果手指受到感染会诱发甲沟炎，导致疼痛。外伤皮肤破损后会导致细菌侵袭，引起感染性的疼痛。
最后，手指处长有软骨瘤也会引起患处疼痛，需要尽快治疗。