来月经时小腹、肛门都疼，建议到正规医院妇产科去就诊，查明造成小腹、肛门都疼的原因，给予规范性治疗。来月经时小腹、肛门都疼，这种情况属于一种病理现象，能够造成这种病理情况的疾病有盆腔急性炎症、子宫内膜异位症。
另外，宫外孕破裂造成盆腔内出血时，也会出现阴道出血，小腹、肛门坠痛，就像是来月经一样。但是这几种疾病的患病时间的长短以及发病的过程不同，临床表现也有一定的差异。急性盆腔炎来月经时小腹、肛门疼痛，同时会伴有月经量的增多或者是发烧。
子宫内膜异位症造成月经期的腹痛和肛门疼痛是继发性的痛经，并且是进行性的加重。而宫外孕破裂时阴道出血、小腹肛门疼，一般会有停经史并且化验血HCG增高。所以出现月经时小腹、肛门疼痛，建议到正规医院及时就诊，给予规范治疗。