舌下腺囊肿复发时需要进行口腔检查，拍摄X光片后制订手术方案。如果囊肿体积较小可以沿囊肿周边0.5~1cm，采用激光或微波烧灼的方法去除囊肿。
如果囊肿体积较大且囊壁较薄，与薄脆的舌下腺很难完全分离，有残留的组织可能会引起复发。最好在全麻下切开口底黏膜逐层分离软组织，结扎粗大的血管，保护舌下及舌咽神经，将舌下腺完整摘除后严密缝合。必要时可以放置橡皮引流条，一般7~10天左右能初步愈合，然后可以拆除缝线。