流脑疫苗和新型冠状病毒疫苗不存在冲突的问题，但是两个疫苗最好不要放在一起接种，需要间隔的时间大概是四周的时间。
流脑疫苗主要是预防流行性脑膜炎所生产的疫苗，采用的是细菌的多糖而制成的疫苗。新型冠状病毒制成的新冠疫苗是采用新冠病毒RNA分子的片段，也就是有效的生物片段，所制成的能够对新型冠状病毒产生预防作用的疫苗。
两个疫苗预防的，一个是细菌引起的传染病，一个是新冠病毒引起的传染病，都会有疫苗接种反应。在诱导机体产生抗体和保护性的免疫力的过程中，应该是不发生冲突的。