孤立肾可能为肾脏发育不良所导致。
由于肾脏通常为输尿管芽组织发育而来。当胚胎在发育时，如果输尿管芽没有正常地发育，或者是出现发育异常的情况，就会导致这一侧的肾脏结构和功能出现异常，从而引起孤立肾。有部分孤立肾还可能为后天性因素所导致，比如在患有肾脏恶性肿瘤或者是肾脏遭受严重的外伤后，可能会将单侧的肾脏进行切除，就可引起孤立肾。
因此，在日常应当做好预防措施，在进行剧烈运动，应当加强对肾脏保护。也不要随意地使用一些药物，比如庆大霉素、卡那霉素等，避免对肾脏造成损伤。