一、遗传因素，家族中有同类的患儿，它的患病率会高于普通的人群。
二、脑器质性方面的因素，该患儿可能在出生时窒息史损害史或者神经系统的异常癫痫，这些都可能会导致孤独症。
三、神经生化因素，有研究发现孤独症患儿里面的血五羟色胺浓度高，脑积液中多巴胺的及其代谢产物的水平也会增高，这些都可能会出现孤独症的刻板行为，四免疫学的因素，孤独症患儿血里面的免疫细胞数量减少，可能是患儿会在婴儿期或新生儿期容易受到感染，导致中枢神经系统的受损，从而发生孤独症。