扁平疣的复发因素比较多，大部分跟机体免疫力低下有关系。此外，往往存在一定遗传易感性，还有一定家族性现象。
对于这种情况，需要在医生指导下接受抗病毒药物治疗，比如口服抗病毒药物治疗，涂抹干扰素凝胶治疗，还可以通过口服转移因子胶囊提高机体免疫力。
如果扁平疣患者出现局部小疙瘩会影响外观，是由病毒感染造成的，有可能会出现反复发作。一定不可以使用手部过度搔抓，避免发生感染，有可能造成病情加重。