幽门螺旋杆菌值1000是否严重，要看是否合并其他疾病。如果单纯的幽门螺旋杆菌值1000，仅仅说明胃内感染的幽门螺杆菌可能比较多，但是没有出现其他的胃黏膜病变，一般不严重。需要及时根除幽门螺杆菌治疗，预后通常比较好。
如果幽门螺旋杆菌值1000同时伴有慢性萎缩性胃炎，一般也不严重，同时治疗慢性萎缩性胃炎和幽门螺杆菌感染后，预后也比较好。如果同时合并胃溃疡，可能病灶不容易愈合，可以适当延长抑酸药和胃黏膜保护剂的疗程，一般也能治愈，不算严重。
如果同时合并胃癌，一般比较严重，需要外科手术治疗或化疗，术后需要定期复查电子胃镜检查。