甲功五项在不同的医院指的项目不同。有的指的是三碘甲状腺原氨酸、游离三碘甲状腺原氨酸、甲状腺素、游离甲状腺素、促甲状腺素。另外一些医院，则是指游离三碘甲状腺原氨酸、游离甲状腺素、促甲状腺素，甲状腺过氧化物酶抗体，甲状腺球蛋白抗体。
通过甲功五项的检查，可以初步地进行甲状腺功能亢进症激素水平的判断，以及引起甲亢病因的评估。如果是单纯的游离三碘甲状腺原氨酸、游离甲状腺素升高，促甲状腺素降低，而抗体水平正常，则考虑是甲状腺毒症。要注意排除亚急性甲状腺炎、化脓性甲状腺炎等甲状腺损伤所导致的。
而如果同时有抗体的升高，则要进一步地检查其他指标，来进一步判断是否由于毒性弥漫性甲状腺肿所引起的甲亢。