咽峡炎疱疹在患病后，大多数患者，也就是身体抵抗力状态正常的人群，通常会在7~14天左右的时间，疱疹自行地消退。因为身体的抵抗力清除引发咽峡疱疹的病毒需要一定的时间，通常病程就在1~2周左右。
所以针对临床症状并不严重的咽峡炎患者，通常并不需要特殊治疗，做好相关护理工作，适当休息，适当禁声即可。
但是针对临床症状严重的咽峡炎患者，就需要根据身体发热、咽喉肿痛等临床症状，来适当用药缓解。