肾结石堵住尿道后，应当先确定结石所在的位置，然后再进行相应的处理。
如果结石处于前尿道，可以将石蜡油注入尿道，使尿道足够润滑，然后轻轻地用手将结石挤出。如果用手难以挤出，还可通过血管钳将结石取出。如果结石堵塞住了后尿道，可以先使用尿道探子将结石推入到膀胱内，然后再通过碎石术将结石击碎，碎石可随同尿液排出体外。
如果结石已经引起了感染，则应当先使用抗生素类的药物控制感染。感染得到有效控制后再进行排石处理，在排石过程中，患者也要加大饮水量，多排尿。