儿童肝功能中总胆红素偏高，绝大部分是先天性胆红素代谢异常性疾病。比较常见的有杜宾-约翰逊综合征、Roter综合征等，这些疾病是由于代谢胆红素的葡萄糖醛酸酶数量不足，或者功能异常导致。这种情况下儿童肝功能总胆红素偏高程度轻微，一般不需要特殊处理。
其次，一些遗传性的代谢性疾病，如肝豆状核变性。这些疾病有可能由于肝脏损伤，从而导致总胆红素升高。
此外，可能是由于儿童肝脏感染病毒。如甲肝、戊肝、EB病毒等，都会造成肝脏炎症损伤，有可能进一步损伤肝内胆管，由此引起总胆红素偏高。