扁桃腺炎和气管炎都是呼吸道方面的炎症，可以见于细菌感染也可以是病毒感染或者支原体、衣原体的感染。二者的主要区别，
第一是感染的部位不同，扁桃腺发炎感染的部位是在扁桃腺；而气管炎发炎的部位是在气管。
第二，二者的症状不同。尽管扁桃腺炎和气管炎，都可以有发热的症状，但是扁桃腺炎主要是咽部的肿大和疼痛，患者在进食或喝水时有明显的咽部疼痛的症状；而气管炎主要的症状是咳嗽咳痰等。
第三辅助检查。做胸片检查时、那么气管炎可以明显看到肺部有肺纹理的增加，而扁桃腺炎。肺纹理是没有问题的。
总之通过临床症状、化验检查和相应的影像学检查，可以明确诊断到底是气管炎还是扁桃腺炎，然后再选择合适的治疗方案，控制感染。