肾脏囊肿发生癌变的可能性极小。临床上遇到的肾囊肿大部分都是单纯性，而遗传性肾囊肿的占比很小，但是随着年龄的增长肾囊肿的发病率会逐渐增加。
肾囊肿属于一种良性病变，如果囊肿直径小于5cm，而且没有压迫症状、没有血尿等不适，一般不需要进行治疗。但是如果囊肿直径大于5cm，患者伴有血尿等症状需要行手术治疗，目前主要采取微创手术治疗的方式，包括腹腔镜下肾囊肿去顶减压术和B超引导下囊肿穿抽液刺硬化治疗等。
肾囊肿属于一种良性病变，很少发生恶变，大部分肾脏囊肿恶变是在手术过程中偶然发现，需要根据肾癌的分期来改变手术方式。