宝宝大便有酸味一般是消化不良等原因引起的，此时可以通过服用促进肠胃消化的药物进行缓解，但服用的药物要在医生指导下进行，以免宝宝出现不良反应，如健胃消食口服液等。
若宝宝的大便酸味较轻或无其他不适症状时，可以通过服用健脾消积的药品或益生菌进行缓解，但要选择对身体影响较小或难以形成依赖的药物。大便长期有酸味时，则要及时进行大便常规检测，并对症治疗，以免宝宝的不适症状加重，甚至影响身体健康。
服用药物时还要注意宝宝的饮食，避免食用刺激性的食品，以免胃肠的不适感加重。