一般即使肝癌早期的病人做手术，也存在着风险。
这种风险首先来自全麻。在全麻过程中，可能随时会出现麻醉的意外，比如出现心脑血管的意外等情况。此外在手术中也有一定风险，早期肝癌一般需要进行肝叶或者肝段的切除手术，手术中可能会并发大出血的现象，并且由于很多肝癌的病人有肝硬化，肝功能并不太好，凝血因子也可能会出现轻微异常，这个时候一旦出现了大出血，常常不容易止血而危及病人的生命。
此外由于肝癌病人往往抗感染能力低下，在手术之后可能会出现伤口愈合障碍。