生殖器疱疹感染的治疗办法，主要包括局部治疗、全身治疗等，具体需根据个人症状以及病情来选择合适的治疗措施。
生殖器疱疹，如果患者只是亚临床感染，通常无需药物进行治疗。如果感染之后有症状，比如局部有红斑、水疱、疼痛，可以局部外用药物治疗，比如使用3%硼酸溶液或生理氯化钠溶液进行清洗，再外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏等抗病毒药剂治疗。
生殖器疱疹感染之后，情况比较严重时，需全身系统性药物治疗，可口服抗病毒药物治疗，常用药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦等。如果属于播散型HSV感染，通常要在医生指导下静脉滴注药物治疗。