得了新冠肺炎后，有少数患者可能会存在后遗症，而大部分的患者预后比较好。
如果患者的病情较轻，出院后一般没有后遗症发生，一部分年龄比较大的患者或者重症患者，往往容易留下一些后遗症。在患病期间肺部容易受到损伤，可能会遗留肺间质纤维化，胸部CT会出现条索状改变。患者可能会表现为不同程度的咳嗽、气喘等症状，严重的可出现不可逆的呼吸衰竭。
新冠肺炎在损伤心脏时，可能会引起心力衰竭和心肌炎，表现为心律失常、胸闷、心悸、气促等症状；大脑受损时，可导致视力和嗅觉异常，严重的会诱发中风；另外，部分患者会出现肌萎缩、容易疲倦、肌张力降低等躯体功能异常的现象。