肛门内部疼痛但无便血，可能是由于陈旧性肛裂或者肛窦炎等疾病引起的，可以外用痔疮药膏消肿止痛对症治疗，必要时可行手术治疗。
当肛门内部疼痛但无任何的便血症状，可能是由于肛窦炎引起的，长期进食辛辣、刺激性的食物或者慢性腹泻可引起慢性的肛窦炎，常见的临床表现为肛门口烧灼痛、胀痛或者肛门坠胀不适，可以进行肛门温水坐浴，促进血液循环，配合外用痔疮药膏消炎、消肿、止痛等治疗，疗效较好。
陈旧性的肛裂，裂口表面可形成假性愈合，可以引起肛门疼痛，但无便血症状或者便血量很小，不易发现，保守治疗效果差，需要进行肛裂手术治疗。