涎腺病毒病的治疗，主要以抗病毒治疗以及抗炎治疗为主。抗病毒治疗的药物多以中成药为主，比如双黄连、板蓝根等；抗炎治疗的目的是缓解全身症状，并防止细菌感染加重。
患者在治疗期间也可进行自我调节，有助于促进疾病的恢复，比如尽量卧床休息，增加饮水量，多进食利尿的食物，有助于将病毒尽快排出体外。由于涎腺病毒病具有一定的传染性，在发病后应做好隔离工作，尽量不要传染给他人。
涎腺病毒一旦发生后，应及早进行治疗，如果治疗不及时，很有可能会引发脑睾丸炎及脑膜炎等并发症，这对身体健康影响是很大。