小儿口腔溃疡可以应用西瓜霜喷雾剂、口腔炎喷雾剂等。这些喷雾剂具有清热解毒、缓解疼痛、抗炎等作用，应用于治疗小儿口腔溃疡有着较好的治疗效果。但需要注意在用药期间，应注意保持孩子的口腔干净、卫生，避免让孩子吃辛辣刺激的食物，防止口腔溃疡反复多次出现，再应用上述喷雾剂可能会使药效大打折扣。
除了应用上述喷雾剂以外，还应针对病因对症处理。小儿口腔溃疡多数是由于上火或细菌性感染所引起。如果为细菌性感染所引起，还需要服用抗菌消炎药物，比如头孢克肟、替硝唑等。如果是上火所引起，需要配合服用金银花颗粒、牛黄解毒片等药物。
在康复期间，避免吃生冷、寒凉以及刺激性较强的食物，平时也应注意口腔卫生。