心脏神经官能症临床症状多而体征较少，找不到器质性心脏病的证据，但在做出诊断前必须排除以下疾病，器质性心脏病，如冠状动脉性心脏病有心电图心肌缺血的改变，冠状动脉造影能明确诊断，风湿性心脏病为风湿热导致的心脏瓣膜损害，心脏彩超可观察瓣膜病变的部位、类型、程度及房室大小、室壁厚度、心室功能等。对此类疾病诊断敏感可靠，可以鉴别，心肌炎多为病毒感染所致，可出现各种类型心律失常，心脏MRI诊断价值大，心肌病目前病因不明，多与遗传因素有关，多表现为心室肥厚或扩张，通过心脏彩超可以鉴别。甲状腺功能亢进症为甲状腺激素分泌过多，可出现易激动、烦躁失眠、心悸、乏力、怕热、多汗等症状，通过甲状腺功能检查可以鉴别。嗜铬细胞瘤释放大量儿茶酚胺引起阵发性或持续性高血压，发作时可有心悸、大汗、焦虑、烦躁等症状，通过血、尿儿茶酚胺及其代谢物测定，B超、CT、MRI等影像学检查可以鉴别。