不同因素所引起的手指根疼，治疗方式也不一样。
如果是急性损伤所导致的手指根疼，通常还伴有肿胀的症状。应当及时地使用冰袋进行冷敷，并且加强患处保护。恢复期，可以使用活血化瘀的药物进行治疗，比如舒筋活血片、活血止痛胶囊等。也可配合进行理疗，比如中药熏洗、热敷等，均有一定效果。
如果是狭窄性腱鞘炎所引起的手指根疼，在初期时，主要进行保守治疗或者封闭治疗。如果腱鞘炎比较严重，或使用以上疗法没有太大的效果，应考虑手术治疗。