小儿腺病毒肺炎的危害最主要的是长时间的发烧，表现为高烧不退，幼儿大约需要10 天左右才能够退热。
高烧会导致小儿精神萎靡、食欲不振等，严重的还会引起抽风、讲胡话等。另外，如果这个病没有经过正规治疗或者延误的治疗，非常容易引起很多并发症，可以合并细菌性感染，影响肺部的功能，甚至可能导致其它器官受损，如心功能、肺功能受损。
小儿在得了腺病毒肺炎后，一定要在医生的指导下正规治疗，用利巴韦林、阿昔洛韦等抗病毒的药物，对症退热、吸氧等。