嗳腐酸臭可以选择使用保和丸、枳实导滞丸、清胃散、丁香散等药物进行治疗。之所以有如此多的药物，可以进行选择，是由于患者的症状不同，因而需要选择不同的用药。
在临床治疗当中，如果患者出现嗳腐酸臭的症状，应当依据患者的舌脉体征进行鉴别，并且选用不同的药物进行治疗。对于有胃中实火所引起的嗳腐酸臭的患者，可以选择使用清胃散以达到更好的治疗效果，通过清理胃热，恢复患者的脾胃正常功能，达到治疗效果。
而如果是由于食积肠胃所引起的嗳腐酸臭，则主要以消食导滞为主，保和丸和枳实导滞丸可以起到更好的效果。