舌下腺囊肿是不会自愈的。
在临床上，如果患者口底有泡状肿物的存在，没有明显疼痛感，可以考虑是舌下腺囊肿。而这个舌下腺囊肿有可能会自行消失，不过并不意味着是自愈，只是由于囊壁破裂，继而造成囊肿里的液体流出，从而暂时缩小消失。随着时间的推移，破裂的囊壁就会慢慢愈合，接着又会引起囊液潴留，形成囊肿。
因此，舌下腺囊肿想要根治，必须接受手术治疗，通过手术治疗切掉囊肿；同时，把舌下腺一并切除，才可以达到根治的目的，建议及早检查治疗。