功能性下丘脑性闭经是属于继发性闭经的一种类型。指中枢神经系统及下丘脑各种功能和器质性疾病引起的闭经，以功能性原因为主。此类闭经的特点是下丘脑合成和分泌GnRH 缺陷或者下降导致垂体促性腺激素，即卵泡刺激素，特别是黄体生成素的分泌功能低下，故属于低促性腺激素性闭经，治疗及时尚可逆。
功能性下丘脑性闭经的预防:要注意树立正确的健康观念和生活方式，包括积极治疗全身性的疾病，提高机体抵抗力，供给足够的营养，保持标准的体重。
运动性闭经应适量减少运动，应急和精神因素所致的闭经应进行耐心的心理的治疗。消除精神紧张和焦虑，平日保持愉快的心情，不熬夜。如有肿瘤等引起的闭经应对应治疗。