肝胆管结石根据病程及病理的不同，其临床表现可以是多方面的，从早期的无明显临床症状的局限于肝内胆管某段肝管内的结石，至后期遍及肝内外胆管系统甚至并发胆汁性肝硬化、肝萎缩、肝脓肿等的晚期病例。
肝胆管结石的手术原则是，切除病灶，通畅引流。而随着微创手术的广泛开展和技术成熟，现在可以行微创下胆总管切开取石，并且可以做肝叶部分切除，然后胆管会师，通过胆道镜取石，并放置引流管引流胆汁。关于密布肝内的胆管结石情况，那么做一次或许还不能取干净结石，还需要反复多次胆道镜取石。