首先应分清引起肛门疼痛的原因是什么。
当内痔发生嵌顿时，因组织局部缺血水肿会导致剧烈疼痛，这时最重要的是活血化瘀、消肿止痛，使用的药物都是活血祛瘀的，消炎药只是辅佐使用，如红霉素软膏外抹。
当患有肛裂时，因陈旧性肛裂导致肛门括约肌痉挛也可导致剧烈疼痛，治疗陈旧性肛裂，消炎药无明显效果，只有手术切除效果才好。
当患有肛周脓肿时，原则是及时手术切开根治，将脓液放出来，取少许脓液送细菌培养，进行药物敏感实验，待检出敏感消炎药物后给予静滴治疗，这样的处理是最安全的。