对于卵巢囊肿的女性，并不一定会出现疼痛的症状，只是卵巢囊肿在出现扭转或者破裂，可能会引起下腹部左侧或者右侧出现持续的或者是胀痛，甚至是痉挛一样的疼痛。
对于盆腔炎症引起的卵巢炎性的囊肿，可能整个下腹部都疼痛。如果女性是卵巢巧克力囊肿，通常在月经来潮期间，会出现下腹部左侧或者右侧的疼痛，而且疼痛的症状越来越严重。
对于卵巢巧克力囊肿出现扭转或者破裂的女性，往往可能需要做急诊的开腹手术进行抢救治疗，而且手术以后要配合药物治疗，避免巧克力囊肿再次的出现复发。