疱疹性口腔溃疡，如果病情不是很严重，可通过局部治疗来改善，如果病情十分严重，可通过局部治疗联合全身治疗来缓解。
局部治疗主要是使用消炎类药物、止痛类药物以及糖皮质激素类药物来进行消炎、止痛，防止继发感染，促进溃疡的愈合。全身治疗主要是使用糖皮质激素，以及免疫增强剂、免疫抑制剂来进行对因治疗，减少溃疡的复发。
另外，患者也可以服用一些中药汤剂或者中成药来进行治疗。如果疱疹性口腔溃疡是由于维生素与微量元素缺乏引起的，患者在治疗期间也可以适当的进行补充，可促进溃疡的好转。