水疱型脚气的治疗，首先是外用抗真菌的药膏，如硝酸益康唑乳膏、阿莫罗芬乳膏或者特比萘芬乳膏等，连续使用两三个星期左右，一般症状能得到较好的控制，症状消退后，再使用两个星期，复发的可能性就少得多。
除了使用药膏以外，还可以使用收敛、消炎、止痒的药物，如：炉甘石洗剂。一般情况下水泡型的脚气治疗的时候不需要把水疱弄破 ，水疱可以自行慢慢地干涸结痂。
如果水疱出现破溃的情况，需要使用抗菌消炎的药膏，如：夫西地酸乳膏、红霉素软膏。