脓肾伴结石的手术方法要看病情的严重程度。如果脓肾的病情相对较轻，首先要积极的控制炎症，炎症得到控制之后，再进行肾结石的手术治疗，否则就会容易导致肾脏炎症的扩散，甚至导致肾功能受到损伤。
如果脓肾的感染特别严重，发生了严重的全身性的感染，患者可能会发生感染性休克，甚至危及患者的生命。
对于后一种情况，一定要准确的评估病情，如果炎症难以控制，一定要及时的将脓肾切除，这样才能有效的控制炎症，避免发生生命危险。