肛周脓肿手术后在一个月左右可以恢复，肛周脓肿的手术可以分为局部切开引流以及脓肿根治性手术，切开引流是患者体弱多病、高龄、基础疾病较严重、免疫力低下的患者，其目的是及早解除脓肿压力，减轻患者痛苦。
在基础疾病好转，机体免疫力，抵抗力增加时，择期行肛瘘手术。这种手术方式简单，危险性小，患者住院时间短，十天左右可以出院。
如果在探查时，能够顺利发现齿状线附近脓肿内口。可以用探针沿着内口到达脓腔，沿探针走向行脓肿切开达到根治目的，恢复时间较长。