阴茎长短跟年龄、本身的发育状况，也和遗传有一定关系。
婴幼儿及青春发育期以前的男性阴茎比较短小，进入青春发育期以后，睾丸分泌的睾酮类激素显著增加，这样就使阴茎开始快速发育，阴茎逐渐增大、增粗。到了性成熟期，阴茎发育逐渐停止，中年和老年男性阴茎大小、长短不再发生变化。
有很多男性到了性成熟期阴茎仍然比较短小，这与本身的发育有关，其内在原因可能是染色体以及基因的异常。阴茎长短和遗传也有一定关系，有很多父代巨大阴茎的，其子代可以表现为巨大阴茎。