孕妇羊水少会导致围产儿病死率明显增高。如果是轻度的羊水少，病死率有研究表明会增高13倍。如果是重度的羊水过少，病死率可以增高47倍。死亡的原因主要是胎儿畸形、胎儿缺氧等问题。
羊水少如果发生在怀孕的早期，胎膜与胎体粘连容易造成胎儿畸形甚至肢体短缺等。如果发生在妊娠中期，子宫外压力直接作用在胎儿身上，容易引起胎儿肌肉骨骼畸形，比如斜颈、手足畸形等。
先天性无肾导致的羊水过少，可引起Potter综合症，表现有肺发育不全、弓形腿、扁平鼻等，这种情况预后都是比较差的，多数患儿在分娩以后会死亡。