对于肾积水，一定要找到引起积水的原因，才可以决定怎样进行治疗。肾积水最常见的原因就是结石导致的。对于小的结石，必须将其排出体外，解除梗阻，积水就会缓解；对于大的结石，需要通过输尿管镜、体外波碎石或者经皮肾镜手术将结石击碎，这样才可以缓解积水。
如果是先天性的肾输尿管连接处狭窄导致，应该行输尿管肾盂成形手术。如果是输尿管狭窄或者输尿管肿瘤引起的肾积水，也应该进行手术治疗。对于结核引起的肾积水，输尿管僵硬，这种情况应该抗结核治疗。一般6到8个月后，积水会明显缓解。如果是前列腺增生导致的残余尿增多引起上尿路积水，应该治疗前列腺增生。