支气管肺发育不良的患者脱氧主要依靠的是患儿年龄增长、肺部组织生长发育、肺功能逐渐完善，待患儿自主呼吸足够满足其身体氧需求后可以考虑脱氧。
目前还没有发现特效药物可以治疗支气管发育不良，但是认为激素具有一定程度地促进患儿肺组织发育的功能，可能可以加快支气管肺发育不良患儿的脱氧速度。
除此之外，此类患儿还很有可能需要使用利尿剂，尽可能地避免患儿出现肺水肿。另外值得注意的是，本病患儿即使在脱氧后，肺组织的免疫能力仍然弱于健康的同龄人，有较大可能发生肺炎。