核酸检测取样一般不疼，但是根据医生的操作熟练度、患者疼痛敏感度的不同，可能部分患者会有不适甚至疼痛的感觉。
核酸检测取样为咽拭子取样，目前有两种取样方式：经口腔的口咽拭子取样、经鼻腔的鼻咽拭子取样，两种取样方式不同，不适程度也有所差异。一般鼻咽拭子取样操作难度相对较大，不适感比较强，现在很少采用。
口腔拭子取样技术敏感性低，患者不适感低，配合好时，不适过程不超过20秒，很快就能结束，所以患者大可不必过于担心。
部分患者如果由于配合不佳、医生操作不熟练、患者疼痛敏感性低，而出现喉咙肿痛，此时只需要多喝热水，尽量少说话，不吃辛辣刺激食物，很快就能恢复。