太阳穴两侧跳痛、想吐的原因如下：
1.高血压。血压突然之间增高的时候，会引起颅内血管扩张，这时候会出现太阳穴两侧跳痛、想吐的症状，应根据血压的情况，选择降压药物调整血压。
2.偏头痛。本病发病后会出现两侧太阳穴搏动的疼痛，发病的时候可伴有典型的先兆，例如视觉先兆、听觉先兆等，对声音和光线比较敏感。
3.感染性疾病。例如当发生病毒或细菌感染的时候，形成菌血症和毒血症，会出现两侧太阳穴疼痛，并伴有发热、全身无力等症状。