体外超声碎石对结石的大小有要求。临床上建议此法用于直径小于2.5厘米的结石，这是因为太大的结石碎石效果较差。
一是结石体积太大不容易碎裂，常常需要进行多次碎石或需要更大能量的超声波才能使结石碎裂，这样会增加患者的痛苦，甚至增加超声碎石术的风险。
二是结石体积太大碎石后会产生更多的小结石，需要更长的时间才能清除干净，这些小结石长时间停留在局部，容易与其周围组织粘连，导致碎石后难以排出，残余结石率较高。