男性龟头发痒的原因常见于龟头炎，滴虫、霉菌等病菌在龟头部位滋生、感染，炎性刺激引起的发痒感觉。
另一原因要考虑是包皮过长，造成龟头包皮部位卫生清洗困难，受到包皮内积聚的污垢刺激引起发痒。
还有一种可能的原因是过敏性发痒，常发生于进食敏感食物或接触敏感环境后，局部的组胺释放引起瘙痒感觉。
可通过查看龟头、包皮的外观性状，取龟头部位标本化验，必要时做过敏原检查，根据检查提示可明确龟头发痒的诱因，针对诱因治疗才能达到发痒的治疗目的。